The somatic genomic landscape of glioblastoma.

Details

Request a copyRequest a copy
Serval ID
serval:BIB_F2BA86F28F31
Type
Article: article from journal or magazin.
Collection
Publications
Institution
Production externe
Title
The somatic genomic landscape of glioblastoma.
Journal
Cell
Author(s)
Brennan C.W., Verhaak R.G., McKenna A., Campos B., Noushmehr H., Salama S.R., Zheng S., Chakravarty D., Sanborn J.Z., Berman S.H., Beroukhim R., Bernard B., Wu C.J., Genovese G., Shmulevich I., Barnholtz-Sloan J., Zou L., Vegesna R., Shukla S.A., Ciriello G., Yung W.K., Zhang W., Sougnez C., Mikkelsen T., Aldape K., Bigner D.D., Van Meir E.G., Prados M., Sloan A., Black K.L., Eschbacher J., Finocchiaro G., Friedman W., Andrews D.W., Guha A., Iacocca M., O'Neill B.P., Foltz G., Myers J., Weisenberger D.J., Penny R., Kucherlapati R., Perou C.M., Hayes D.N., Gibbs R., Marra M., Mills G.B., Lander E., Spellman P., Wilson R., Sander C., Weinstein J., Meyerson M., Gabriel S., Laird P.W., Haussler D., Getz G., Chin L.
Working group(s)
TCGA Research Network
Contributor(s)
Benz C., Barnholtz-Sloan J., Barrett W., Ostrom Q., Wolinsky Y., Black K.L., Bose B., Boulos P.T., Boulos M., Brown J., Czerinski C., Eppley M., Iacocca M., Kempista T., Kitko T., Koyfman Y., Rabeno B., Rastogi P., Sugarman M., Swanson P., Yalamanchii K., Otey I.P., Liu Y.S., Xiao Y., Auman J.T., Chen P.C., Hadjipanayis A., Lee E., Lee S., Park P.J., Seidman J., Yang L., Kucherlapati R., Kalkanis S., Mikkelsen T., Poisson L.M., Raghunathan A., Scarpace L., Bernard B., Bressler R., Eakin A., Iype L., Kreisberg R.B., Leinonen K., Reynolds S., Rovira H., Thorsson V., Shmulevich I., Annala M.J., Penny R., Paulauskis J., Curley E., Hatfield M., Mallery D., Morris S., Shelton T., Shelton C., Sherman M., Yena P., Cuppini L., DiMeco F., Eoli M., Finocchiaro G., Maderna E., Pollo B., Saini M., Balu S., Hoadley K.A., Li L., Miller C.R., Shi Y., Topal M.D., Wu J., Dunn G., Giannini C., O'Neill B.P., Aksoy B.A., Antipin Y., Borsu L., Berman S.H., Brennan C.W., Cerami E., Chakravarty D., Ciriello G., Gao J., Gross B., Jacobsen A., Ladanyi M., Lash A., Liang Y., Reva B., Sander C., Schultz N., Shen R., Socci N.D., Viale A., Ferguson M.L., Chen Q.R., Demchok J.A., Dillon L.A., Shaw K.R., Sheth M., Tarnuzzer R., Wang Z., Yang L., Davidsen T., Guyer M.S., Ozenberger B.A., Sofia H.J., Bergsten J., Eckman J., Harr J., Myers J., Smith C., Tucker K., Winemiller C., Zach L.A., Ljubimova J.Y., Eley G., Ayala B., Jensen M.A., Kahn A., Pihl T.D., Pot D.A., Wan Y., Eschbacher J., Foltz G., Hansen N., Hothi P., Lin B., Shah N., Yoon J.G., Lau C., Berens M., Ardlie K., Beroukhim R., Carter S.L., Cherniack A.D., Noble M., Cho J., Cibulskis K., DiCara D., Frazer S., Gabriel S.B., Gehlenborg N., Gentry J., Heiman D., Kim J., Jing R., Lander E.S., Lawrence M., Lin P., Mallard W., Meyerson M., Onofrio R.C., Saksena G., Schumacher S., Sougnez C., Stojanov P., Tabak B., Voet D., Zhang H., Zou L., Getz G., Dees N.N., Ding L., Fulton L.L., Fulton R.S., Kanchi K.L., Mardis E.R., Wilson R.K., Baylin S.B., Andrews D.W., Harshyne L., Cohen M.L., Devine K., Sloan A.E., VandenBerg S.R., Berger M.S., Prados M., Carlin D., Craft B., Ellrott K., Goldman M., Goldstein T., Grifford M., Haussler D., Ma S., Ng S., Salama S.R., Sanborn J.Z., Stuart J., Swatloski T., Waltman P., Zhu J., Foss R., Frentzen B., Friedman W., McTiernan R., Yachnis A., Hayes D.N., Perou C.M., Zheng S., Vegesna R., Mao Y., Akbani R., Aldape K., Bogler O., Fuller G.N., Liu W., Liu Y., Lu Y., Mills G., Protopopov A., Ren X., Sun Y., Wu C.J., Yung W.K., Zhang W., Zhang J., Chen K., Weinstein J.N., Chin L., Verhaak R.G., Noushmehr H., Weisenberger D.J., Bootwalla M.S., Lai P.H., Triche T.J., Van Den Berg D.J., Laird P.W., Gutmann D.H., Lehman N.L., VanMeir E.G., Brat D., Olson J.J., Mastrogianakis G.M., Devi N.S., Zhang Z., Bigner D., Lipp E., McLendon R.
ISSN
1097-4172 (Electronic)
ISSN-L
0092-8674
Publication state
Published
Issued date
10/10/2013
Peer-reviewed
Oui
Volume
155
Number
2
Pages
462-477
Language
english
Notes
Publication types: Journal Article ; Research Support, N.I.H., Extramural ; Research Support, Non-U.S. Gov't
Publication Status: ppublish
Abstract
We describe the landscape of somatic genomic alterations based on multidimensional and comprehensive characterization of more than 500 glioblastoma tumors (GBMs). We identify several novel mutated genes as well as complex rearrangements of signature receptors, including EGFR and PDGFRA. TERT promoter mutations are shown to correlate with elevated mRNA expression, supporting a role in telomerase reactivation. Correlative analyses confirm that the survival advantage of the proneural subtype is conferred by the G-CIMP phenotype, and MGMT DNA methylation may be a predictive biomarker for treatment response only in classical subtype GBM. Integrative analysis of genomic and proteomic profiles challenges the notion of therapeutic inhibition of a pathway as an alternative to inhibition of the target itself. These data will facilitate the discovery of therapeutic and diagnostic target candidates, the validation of research and clinical observations and the generation of unanticipated hypotheses that can advance our molecular understanding of this lethal cancer.
Keywords
Brain Neoplasms/genetics, Brain Neoplasms/metabolism, Female, Gene Expression Profiling, Gene Regulatory Networks, Glioblastoma/genetics, Glioblastoma/metabolism, Humans, Male, Mutation, Proteome/analysis, Signal Transduction
DOI
10.1016/j.cell.2013.09.034
Pubmed
24120142
Web of science
000325719800021
Open Access
Yes
Create date
06/07/2018 12:02
Last modification date
20/08/2019 17:19
Usage data