The somatic genomic landscape of glioblastoma.

Détails

ID Serval
serval:BIB_F2BA86F28F31
Type
Article: article d'un périodique ou d'un magazine.
Collection
Publications
Titre
The somatic genomic landscape of glioblastoma.
Périodique
Cell
Auteur(s)
Brennan C.W., Verhaak R.G., McKenna A., Campos B., Noushmehr H., Salama S.R., Zheng S., Chakravarty D., Sanborn J.Z., Berman S.H., Beroukhim R., Bernard B., Wu C.J., Genovese G., Shmulevich I., Barnholtz-Sloan J., Zou L., Vegesna R., Shukla S.A., Ciriello G., Yung W.K., Zhang W., Sougnez C., Mikkelsen T., Aldape K., Bigner D.D., Van Meir E.G., Prados M., Sloan A., Black K.L., Eschbacher J., Finocchiaro G., Friedman W., Andrews D.W., Guha A., Iacocca M., O'Neill B.P., Foltz G., Myers J., Weisenberger D.J., Penny R., Kucherlapati R., Perou C.M., Hayes D.N., Gibbs R., Marra M., Mills G.B., Lander E., Spellman P., Wilson R., Sander C., Weinstein J., Meyerson M., Gabriel S., Laird P.W., Haussler D., Getz G., Chin L.
Collaborateur(s)
TCGA Research Network
Contributeur(s)
Benz C., Barnholtz-Sloan J., Barrett W., Ostrom Q., Wolinsky Y., Black K.L., Bose B., Boulos P.T., Boulos M., Brown J., Czerinski C., Eppley M., Iacocca M., Kempista T., Kitko T., Koyfman Y., Rabeno B., Rastogi P., Sugarman M., Swanson P., Yalamanchii K., Otey I.P., Liu Y.S., Xiao Y., Auman J.T., Chen P.C., Hadjipanayis A., Lee E., Lee S., Park P.J., Seidman J., Yang L., Kucherlapati R., Kalkanis S., Mikkelsen T., Poisson L.M., Raghunathan A., Scarpace L., Bernard B., Bressler R., Eakin A., Iype L., Kreisberg R.B., Leinonen K., Reynolds S., Rovira H., Thorsson V., Shmulevich I., Annala M.J., Penny R., Paulauskis J., Curley E., Hatfield M., Mallery D., Morris S., Shelton T., Shelton C., Sherman M., Yena P., Cuppini L., DiMeco F., Eoli M., Finocchiaro G., Maderna E., Pollo B., Saini M., Balu S., Hoadley K.A., Li L., Miller C.R., Shi Y., Topal M.D., Wu J., Dunn G., Giannini C., O'Neill B.P., Aksoy B.A., Antipin Y., Borsu L., Berman S.H., Brennan C.W., Cerami E., Chakravarty D., Ciriello G., Gao J., Gross B., Jacobsen A., Ladanyi M., Lash A., Liang Y., Reva B., Sander C., Schultz N., Shen R., Socci N.D., Viale A., Ferguson M.L., Chen Q.R., Demchok J.A., Dillon L.A., Shaw K.R., Sheth M., Tarnuzzer R., Wang Z., Yang L., Davidsen T., Guyer M.S., Ozenberger B.A., Sofia H.J., Bergsten J., Eckman J., Harr J., Myers J., Smith C., Tucker K., Winemiller C., Zach L.A., Ljubimova J.Y., Eley G., Ayala B., Jensen M.A., Kahn A., Pihl T.D., Pot D.A., Wan Y., Eschbacher J., Foltz G., Hansen N., Hothi P., Lin B., Shah N., Yoon J.G., Lau C., Berens M., Ardlie K., Beroukhim R., Carter S.L., Cherniack A.D., Noble M., Cho J., Cibulskis K., DiCara D., Frazer S., Gabriel S.B., Gehlenborg N., Gentry J., Heiman D., Kim J., Jing R., Lander E.S., Lawrence M., Lin P., Mallard W., Meyerson M., Onofrio R.C., Saksena G., Schumacher S., Sougnez C., Stojanov P., Tabak B., Voet D., Zhang H., Zou L., Getz G., Dees N.N., Ding L., Fulton L.L., Fulton R.S., Kanchi K.L., Mardis E.R., Wilson R.K., Baylin S.B., Andrews D.W., Harshyne L., Cohen M.L., Devine K., Sloan A.E., VandenBerg S.R., Berger M.S., Prados M., Carlin D., Craft B., Ellrott K., Goldman M., Goldstein T., Grifford M., Haussler D., Ma S., Ng S., Salama S.R., Sanborn J.Z., Stuart J., Swatloski T., Waltman P., Zhu J., Foss R., Frentzen B., Friedman W., McTiernan R., Yachnis A., Hayes D.N., Perou C.M., Zheng S., Vegesna R., Mao Y., Akbani R., Aldape K., Bogler O., Fuller G.N., Liu W., Liu Y., Lu Y., Mills G., Protopopov A., Ren X., Sun Y., Wu C.J., Yung W.K., Zhang W., Zhang J., Chen K., Weinstein J.N., Chin L., Verhaak R.G., Noushmehr H., Weisenberger D.J., Bootwalla M.S., Lai P.H., Triche T.J., Van Den Berg D.J., Laird P.W., Gutmann D.H., Lehman N.L., VanMeir E.G., Brat D., Olson J.J., Mastrogianakis G.M., Devi N.S., Zhang Z., Bigner D., Lipp E., McLendon R.
ISSN
1097-4172 (Electronic)
ISSN-L
0092-8674
Statut éditorial
Publié
Date de publication
10/10/2013
Peer-reviewed
Oui
Volume
155
Numéro
2
Pages
462-477
Langue
anglais
Notes
Publication types: Journal Article ; Research Support, N.I.H., Extramural ; Research Support, Non-U.S. Gov't
Publication Status: ppublish
Résumé
We describe the landscape of somatic genomic alterations based on multidimensional and comprehensive characterization of more than 500 glioblastoma tumors (GBMs). We identify several novel mutated genes as well as complex rearrangements of signature receptors, including EGFR and PDGFRA. TERT promoter mutations are shown to correlate with elevated mRNA expression, supporting a role in telomerase reactivation. Correlative analyses confirm that the survival advantage of the proneural subtype is conferred by the G-CIMP phenotype, and MGMT DNA methylation may be a predictive biomarker for treatment response only in classical subtype GBM. Integrative analysis of genomic and proteomic profiles challenges the notion of therapeutic inhibition of a pathway as an alternative to inhibition of the target itself. These data will facilitate the discovery of therapeutic and diagnostic target candidates, the validation of research and clinical observations and the generation of unanticipated hypotheses that can advance our molecular understanding of this lethal cancer.
Mots-clé
Brain Neoplasms/genetics, Brain Neoplasms/metabolism, Female, Gene Expression Profiling, Gene Regulatory Networks, Glioblastoma/genetics, Glioblastoma/metabolism, Humans, Male, Mutation, Proteome/analysis, Signal Transduction
Pubmed
Web of science
Open Access
Oui
Création de la notice
06/07/2018 12:02
Dernière modification de la notice
20/08/2019 17:19
Données d'usage