Narcolepsy risk loci outline role of T cell autoimmunity and infectious triggers in narcolepsy.

Details

Ressource 1Download: 37188663_BIB_57D392F74F52.pdf (4391.84 [Ko])
State: Public
Version: Final published version
License: CC BY 4.0
Serval ID
serval:BIB_57D392F74F52
Type
Article: article from journal or magazin.
Collection
Publications
Institution
UNIL/CHUV
Title
Narcolepsy risk loci outline role of T cell autoimmunity and infectious triggers in narcolepsy.
Journal
Nature communications
Author(s)
Ollila H.M., Sharon E., Lin L., Sinnott-Armstrong N., Ambati A., Yogeshwar S.M., Hillary R.P., Jolanki O., Faraco J., Einen M., Luo G., Zhang J., Han F., Yan H., Dong X.S., Li J., Zhang J., Hong S.C., Kim T.W., Dauvilliers Y., Barateau L., Lammers G.J., Fronczek R., Mayer G., Santamaria J., Arnulf I., Knudsen-Heier S., Bredahl MKL, Thorsby P.M., Plazzi G., Pizza F., Moresco M., Crowe C., Van den Eeden S.K., Lecendreux M., Bourgin P., Kanbayashi T., Martínez-Orozco F.J., Peraita-Adrados R., Benetó A., Montplaisir J., Desautels A., Huang Y.S., Jennum P., Nevsimalova S., Kemlink D., Iranzo A., Overeem S., Wierzbicka A., Geisler P., Sonka K., Honda M., Högl B., Stefani A., Coelho F.M., Mantovani V., Feketeova E., Wadelius M., Eriksson N., Smedje H., Hallberg P., Hesla P.E., Rye D., Pelin Z., Ferini-Strambi L., Bassetti C.L., Mathis J., Khatami R., Aran A., Nampoothiri S., Olsson T., Kockum I., Partinen M., Perola M., Kornum B.R., Rueger S., Winkelmann J., Miyagawa T., Toyoda H., Khor S.S., Shimada M., Tokunaga K., Rivas M., Pritchard J.K., Risch N., Kutalik Z., O'Hara R., Hallmayer J., Ye C.J., Mignot E.J.
Working group(s)
FinnGen
Contributor(s)
Als T.D., Ziemann A., Abbasi A., Lehtonen A., Lertratanakul A., Riley-Gillis B., Rahimov F., Jacob H., Waring J., Liu M., Smaoui N., Popovic R., Platt A., Matakidou A., Challis B., Paul D., Lassi G., Tachmazidou I., Hakanen A., Schleutker J., Pitkänen N., Terho P., Virolainen P., Mannermaa A., Kosma V.M., Chen C.Y., Runz H., John S., Lahdenperä S., Loomis S., Eaton S., Okafo G., Salminen-Mankonen H., Jung M., Lawless N., Ding Z., Maranville J., Hochfeld M., Plenge R., Biswas S., Kanai M., Maasha M., Zhou W., Tuovila O., Pakkanen R., Laukkanen J., Kuopio T., Aittomäki K., Mäkitie A., Pujol N., Laisk T., Aalto-Setälä K., Mäkelä J., Hautalahti M., Smith S., Southerington T., Kangasniemi E., Palin H., Kähönen M., Siltanen S., Laitinen T., Vaura F., Suvisaari J., Niiranen T., Salomaa V., Partanen J., Arvas M., Ritari J., Hyvärinen K., Choy D., Teng E., Strauss E., Chen H., Chen H., Schutzman J., Hunkapiller J., McCarthy M., Bowers N., Pendergrass R., Lu T., Chu A., Kulkarni D., Xu F., Betts J., Eicher J., Gordillo J.E., Addis L., McCarthy L., Mishra R., Kumar J., Ehm M.G., Auro K., Pulford D., Pitkäranta A., Loukola A., Punkka E., Linna M.M., Carpén O., Raivio T., Turunen J.A., Mäkelä T.P., Salminen A., Aarnisalo A., Gordin D., Rice D., Isometsä E., Salminen E., Joensuu H., Kalliala I., Mattson J., Sinisalo J., Koskela J., Eklund K., Hannula-Jouppi K., Aaltonen L., Taskinen M.R., Färkkilä M., Raivio M., Heikinheimo O., Kauppi P., Nieminen P., Tienari P., Pussinen P., Pikkarainen S., Ollila T., Tuomi T., Hiltunen T., Meretoja T., Salo T., Palotie U., Palomäki A., Aittokallio J., Rinne J., Metsärinne K., Elenius K., Pirilä L., Koulu L., Voutilainen M., Lahesmaa R., Kallionpää R., Peltonen S., Willberg T., Gursoy U., Jokimaa V., Palotie A., Kytölä A., Ganna A., Jalanko A., Liu A., Lehisto A., Ghazal A., Kilpeläinen E., Widen E., Saarentaus E., Pitkänen E., Ollila H., Laivuori H., Heyne H., Shen H.Y., Kaprio J., Rämö J., Karjalainen J., Mehtonen J., Pitkänen J., Pärn K., Donner K., Kivinen K., Lahtela L.E., Niemi M.E., Kaunisto M., Kals M., Reeve M.P., Aavikko M., Mars N., Dada O.A., Della Briotta Parolo P., Palta P., Weldatsadik R., Kajanne R., Rodosthenous R., Ripatti S., Ruotsalainen S., Strausz S., Hassan S., Padmanabhuni S.S., Luo S., Lemmelä S., Tukiainen T., Sipilä T.P., Kiiskinen T., Llorens V., Daly M., Lee J., Tsuo K., Kurki M., Elliott A., Havulinna A., Partanen J., Yang R., Reilly D., Porello A., Hart A., Waterworth D., Khramtsova E., He K., Guan M., Li Q.S., Vuoti S., Green E., Graham R., Mozaffari S., Huertas-Vazquez A., Loboda A., Fox C., Farias F., Sul J.H., Miller J., Raghavan N., Longerich S., Kettunen J., Serpi R., Hinttala R., Mantere T., Remes A., Rahikkala E., Huhtakangas J., Tasanen K., Huilaja L., Morin-Papunen L., Niinimäki M., Vääräsmäki M., Uimari O., Karihtala P., Piltonen T., Harju T., Blomster T., Anttonen V., Soininen H., Kaarniranta K., Suominen L., Pelkonen M., Siponen M., Kiviniemi M., Kaipiainen-Seppänen O., Auvinen P., Mäntylä P., Kälviäinen R., Julkunen V., O'Donnell C., Obeidat M.E., Renaud N., Ngo D., Mouded M., Mendelson M., Mälarstig A., Lehtonen H., Parkkinen J., Kalpala K., Miller M., Bing N., McDonough S., Hu X., Wu Y., Jussila A., Auranen A., Bizaki-Vallaskangas A., Uusitalo H., Peltola J., Hernesniemi J., Kaukinen K., Kotaniemi-Talonen L., Isomäki P., Salmi T., Kurra V., Sipilä K., Toivola A., Järvensivu E., Kaiharju E., Mattsson H., Kristiansson K., Männikkö L., Laukkanen M., Perola M., Brunfeldt M., Laiho P., Wong R., Koskelainen S., Lähteenmäki S., Soini S., Paajanen T., Kilpi T., Hiekkalinna T., Sistonen T., Chatelain C., Raipal D., Klinger K., Lessard S., Åberg F., Hiltunen M., Heikkinen S., Kankaanranta H., Palotie T., Hovatta I., Palin K., Välimäki N., Toppila-Salmi S., Laakkonen E., Sliz E., Silven H., Pylkäs K., Karjalainen M., Arffman R., Savukoski S., Tyrmi J., Rivas M., Siirtola H., Vähätalo I., Garcia-Tabuenca J., Niemi M., Helminen M., Luukkaala T.
ISSN
2041-1723 (Electronic)
ISSN-L
2041-1723
Publication state
Published
Issued date
15/05/2023
Peer-reviewed
Oui
Volume
14
Number
1
Pages
2709
Language
english
Notes
Publication types: Journal Article ; Research Support, N.I.H., Extramural ; Research Support, Non-U.S. Gov't
Publication Status: epublish
Abstract
Narcolepsy type 1 (NT1) is caused by a loss of hypocretin/orexin transmission. Risk factors include pandemic 2009 H1N1 influenza A infection and immunization with Pandemrix®. Here, we dissect disease mechanisms and interactions with environmental triggers in a multi-ethnic sample of 6,073 cases and 84,856 controls. We fine-mapped GWAS signals within HLA (DQ0602, DQB1*03:01 and DPB1*04:02) and discovered seven novel associations (CD207, NAB1, IKZF4-ERBB3, CTSC, DENND1B, SIRPG, PRF1). Significant signals at TRA and DQB1*06:02 loci were found in 245 vaccination-related cases, who also shared polygenic risk. T cell receptor associations in NT1 modulated TRAJ*24, TRAJ*28 and TRBV*4-2 chain-usage. Partitioned heritability and immune cell enrichment analyses found genetic signals to be driven by dendritic and helper T cells. Lastly comorbidity analysis using data from FinnGen, suggests shared effects between NT1 and other autoimmune diseases. NT1 genetic variants shape autoimmunity and response to environmental triggers, including influenza A infection and immunization with Pandemrix®.
Keywords
Humans, Autoimmunity/genetics, Influenza, Human/epidemiology, Influenza, Human/genetics, Influenza A Virus, H1N1 Subtype/genetics, Autoimmune Diseases/epidemiology, Autoimmune Diseases/genetics, Influenza Vaccines/adverse effects, Narcolepsy/chemically induced, Narcolepsy/genetics
URN
urn:nbn:ch:serval-BIB_57D392F74F523
OAI-PMH
oai:serval.unil.ch:BIB_57D392F74F52
DOI
10.1038/s41467-023-36120-z
Pubmed
37188663
Web of science
000994445900002
Open Access
Yes
Create date
22/05/2023 15:32
Last modification date
23/01/2024 7:25
Usage data