La thérapie par cellules encapsulées permet de nouvelles solutions pour le traitement de nombreuses maladies. En particulier pour l'administration de substances d'intérêt thérapeutique qui ne peuvent être substituées par aucune substance pharmacologique assimilable par voie orale. Avec le développement rapide des connaissances sur le génome humain, un très grand nombre de nouvelles protéines qui peuvent avoir un intérêt pour le traitement de diverses maladies va rapidement être découvert. La thérapie par cellules encapsulées peut fournir une méthode avantageuse d'administration de ces molécules. Par ailleurs, pour le traitement de maladies telles que le diabète de type I qui nécessitent un relâchement d'insuline régulé par les besoins métaboliques du patient, la thérapie par cellules encapsulées peut se révéler la meilleure méthode possible.