Rare and low-frequency coding variants alter human adult height.

Détails

Ressource 1Télécharger: 2017 Kutalik_Nature.pdf (686.74 [Ko])
Etat: Public
Version: Author's accepted manuscript
ID Serval
serval:BIB_CB04B9543EC2
Type
Article: article d'un périodique ou d'un magazine.
Collection
Publications
Institution
Titre
Rare and low-frequency coding variants alter human adult height.
Périodique
Nature
Auteur⸱e⸱s
Marouli E., Graff M., Medina-Gomez C., Lo K.S., Wood A.R., Kjaer T.R., Fine R.S., Lu Y., Schurmann C., Highland H.M., Rüeger S., Thorleifsson G., Justice A.E., Lamparter D., Stirrups K.E., Turcot V., Young K.L., Winkler T.W., Esko T., Karaderi T., Locke A.E., Masca N.G., Ng M.C., Mudgal P., Rivas M.A., Vedantam S., Mahajan A., Guo X., Abecasis G., Aben K.K., Adair L.S., Alam D.S., Albrecht E., Allin K.H., Allison M., Amouyel P., Appel E.V., Arveiler D., Asselbergs F.W., Auer P.L., Balkau B., Banas B., Bang L.E., Benn M., Bergmann S., Bielak L.F., Blüher M., Boeing H., Boerwinkle E., Böger C.A., Bonnycastle L.L., Bork-Jensen J., Bots M.L., Bottinger E.P., Bowden D.W., Brandslund I., Breen G., Brilliant M.H., Broer L., Burt A.A., Butterworth A.S., Carey D.J., Caulfield M.J., Chambers J.C., Chasman D.I., Chen Y.I., Chowdhury R., Christensen C., Chu A.Y., Cocca M., Collins F.S., Cook J.P., Corley J., Galbany J.C., Cox A.J., Cuellar-Partida G., Danesh J., Davies G., de Bakker P.I., de Borst G.J., de Denus S., de Groot M.C., de Mutsert R., Deary I.J., Dedoussis G., Demerath E.W., den Hollander A.I., Dennis J.G., Di Angelantonio E., Drenos F., Du M., Dunning A.M., Easton D.F., Ebeling T., Edwards T.L., Ellinor P.T., Elliott P., Evangelou E., Farmaki A.E., Faul J.D., Feitosa M.F., Feng S., Ferrannini E., Ferrario M.M., Ferrieres J., Florez J.C., Ford I., Fornage M., Franks P.W., Frikke-Schmidt R., Galesloot T.E., Gan W., Gandin I., Gasparini P., Giedraitis V., Giri A., Girotto G., Gordon S.D., Gordon-Larsen P., Gorski M., Grarup N., Grove M.L., Gudnason V., Gustafsson S., Hansen T., Harris K.M., Harris T.B., Hattersley A.T., Hayward C., He L., Heid I.M., Heikkilä K., Helgeland Ø., Hernesniemi J., Hewitt A.W., Hocking L.J., Hollensted M., Holmen O.L., Hovingh G.K., Howson J.M., Hoyng C.B., Huang P.L., Hveem K., Ikram M.A., Ingelsson E., Jackson A.U., Jansson J.H., Jarvik G.P., Jensen G.B., Jhun M.A., Jia Y., Jiang X., Johansson S., Jørgensen M.E., Jørgensen T., Jousilahti P., Jukema J.W., Kahali B., Kahn R.S., Kähönen M., Kamstrup P.R., Kanoni S., Kaprio J., Karaleftheri M., Kardia S.L., Karpe F., Kee F., Keeman R., Kiemeney L.A., Kitajima H., Kluivers K.B., Kocher T., Komulainen P., Kontto J., Kooner J.S., Kooperberg C., Kovacs P., Kriebel J., Kuivaniemi H., Küry S., Kuusisto J., La Bianca M., Laakso M., Lakka T.A., Lange E.M., Lange L.A., Langefeld C.D., Langenberg C., Larson E.B., Lee I.T., Lehtimäki T., Lewis C.E., Li H., Li J., Li-Gao R., Lin H., Lin L.A., Lin X., Lind L., Lindström J., Linneberg A., Liu Y., Liu Y., Lophatananon A., Luan J., Lubitz S.A., Lyytikäinen L.P., Mackey D.A., Madden P.A., Manning A.K., Männistö S., Marenne G., Marten J., Martin N.G., Mazul A.L., Meidtner K., Metspalu A., Mitchell P., Mohlke K.L., Mook-Kanamori D.O., Morgan A., Morris A.D., Morris A.P., Müller-Nurasyid M., Munroe P.B., Nalls M.A., Nauck M., Nelson C.P., Neville M., Nielsen S.F., Nikus K., Njølstad P.R., Nordestgaard B.G., Ntalla I., O'Connel J.R., Oksa H., Loohuis L.M., Ophoff R.A., Owen K.R., Packard C.J., Padmanabhan S., Palmer C.N., Pasterkamp G., Patel A.P., Pattie A., Pedersen O., Peissig P.L., Peloso G.M., Pennell C.E., Perola M., Perry J.A., Perry J.R., Person T.N., Pirie A., Polasek O., Posthuma D., Raitakari O.T., Rasheed A., Rauramaa R., Reilly D.F., Reiner A.P., Renström F., Ridker P.M., Rioux J.D., Robertson N., Robino A., Rolandsson O., Rudan I., Ruth K.S., Saleheen D., Salomaa V., Samani N.J., Sandow K., Sapkota Y., Sattar N., Schmidt M.K., Schreiner P.J., Schulze M.B., Scott R.A., Segura-Lepe M.P., Shah S., Sim X., Sivapalaratnam S., Small K.S., Smith A.V., Smith J.A., Southam L., Spector T.D., Speliotes E.K., Starr J.M., Steinthorsdottir V., Stringham H.M., Stumvoll M., Surendran P., 't Hart L.M., Tansey K.E., Tardif J.C., Taylor K.D., Teumer A., Thompson D.J., Thorsteinsdottir U., Thuesen B.H., Tönjes A., Tromp G., Trompet S., Tsafantakis E., Tuomilehto J., Tybjaerg-Hansen A., Tyrer J.P., Uher R., Uitterlinden A.G., Ulivi S., van der Laan S.W., Van Der Leij A.R., van Duijn C.M., van Schoor N.M., van Setten J., Varbo A., Varga T.V., Varma R., Edwards D.R., Vermeulen S.H., Vestergaard H., Vitart V., Vogt T.F., Vozzi D., Walker M., Wang F., Wang C.A., Wang S., Wang Y., Wareham N.J., Warren H.R., Wessel J., Willems S.M., Wilson J.G., Witte D.R., Woods M.O., Wu Y., Yaghootkar H., Yao J., Yao P., Yerges-Armstrong L.M., Young R., Zeggini E., Zhan X., Zhang W., Zhao J.H., Zhao W., Zhao W., Zheng H., Zhou W., Rotter J.I., Boehnke M., Kathiresan S., McCarthy M.I., Willer C.J., Stefansson K., Borecki I.B., Liu D.J., North K.E., Heard-Costa N.L., Pers T.H., Lindgren C.M., Oxvig C., Kutalik Z., Rivadeneira F., Loos R.J., Frayling T.M., Hirschhorn J.N., Deloukas P., Lettre G.
Collaborateur⸱rice⸱s
EPIC-InterAct Consortium, CHD Exome+ Consortium, ExomeBP Consortium, T2D-Genes Consortium, GoT2D Genes Consortium, Global Lipids Genetics Consortium, ReproGen Consortium, MAGIC Investigators
ISSN
1476-4687 (Electronic)
ISSN-L
0028-0836
Statut éditorial
Publié
Date de publication
09/02/2017
Peer-reviewed
Oui
Volume
542
Numéro
7640
Pages
186-190
Langue
anglais
Résumé
Height is a highly heritable, classic polygenic trait with approximately 700 common associated variants identified through genome-wide association studies so far. Here, we report 83 height-associated coding variants with lower minor-allele frequencies (in the range of 0.1-4.8%) and effects of up to 2 centimetres per allele (such as those in IHH, STC2, AR and CRISPLD2), greater than ten times the average effect of common variants. In functional follow-up studies, rare height-increasing alleles of STC2 (giving an increase of 1-2 centimetres per allele) compromised proteolytic inhibition of PAPP-A and increased cleavage of IGFBP-4 in vitro, resulting in higher bioavailability of insulin-like growth factors. These 83 height-associated variants overlap genes that are mutated in monogenic growth disorders and highlight new biological candidates (such as ADAMTS3, IL11RA and NOX4) and pathways (such as proteoglycan and glycosaminoglycan synthesis) involved in growth. Our results demonstrate that sufficiently large sample sizes can uncover rare and low-frequency variants of moderate-to-large effect associated with polygenic human phenotypes, and that these variants implicate relevant genes and pathways.

Pubmed
Web of science
Création de la notice
28/02/2017 12:35
Dernière modification de la notice
20/08/2019 15:45
Données d'usage