Candida spp. restent parmi les principales causes d'infections nosocomiales par voie hématogène. Les échinocandines sont recommandées comme traitement de première intention en cas de candidémie. La résistance acquise aux échinocandines, est associée à des mutations se retrouvant sur le hotspot du gène FKS, et elle s’observe principalement chez Candida albicans et Candida glabrata. Le kit commercial, Sensititre YeastOne ™ (SYO), est largement utilisé pour tester la sensibilité aux antifongiques, mais il n’y a pas de « clinical breakpoints » (seuils de distinction entre souches sensibles et résistantes) clairement établis.
Dans cette étude, nous avons étudié la situation épidémiologique de la résistance aux échinocandines en Suisse. Nous avons également déterminé des
« epidemiological cut-off values (ECV) » avec SYO et évalué leur capacité d’identifier les mutants FKS pour C. albicans / glabrata dans cette enquête nationale sur la candidémie.
Plus précisément, plus de 2000 souches de Candida spp. ont été collectées par des patients candidémiques, dans 25 hôpitaux Suisses de 2004 à 2013 et testées par SYO. Un séquençage du hotspot du FKS a été effectué pour les isolats présentant une MIC≥ECV pour au moins une des échinocandines.
Au total, 1277 C. albicans et 347 C. glabrata ont été inclues. L’ECV 97,5% (la valeur supérieure de la CMI incluant le 97.5% des souches sauvage) de la caspofongine, de l'anidulafungine et de la micafungine était respectivement de 0,12, 0,06 et 0,03 μg
/ mL pour C. albicans et de 0,25, 0,12 et 0,03 μg / mL pour C. glabrata. Le séquençage du hotspot du FKS a été effectué pour 70 isolats. Aucune mutation n'a été trouvée dans les 52 isolats « limite sauvages » (MIC = ECV pour au moins une échinocandine). Parmi les 18 isolats « non-sauvages » (MIC> ECV pour au moins une échinocandine), des mutations du FKS ont été retrouvées dans les deux seuls isolats présentant une CMI> ECV pour les trois échinocandines.
En conclusion, cette enquête nationale sur 10 ans a montré que le taux de résistance aux échinocandines chez C. albicans et C. glabrata reste faible en Suisse malgré une augmentation de l’utilisation des échinocandines. Les résultats dérivés de cette grande collection (>2000 souches) peuvent être utiles pour la détermination et l’ajustement des « clinical breakpoints ». En effet les ECV déterminées par SYO peuvent distinguer les mutants FKS des isolats de type sauvage dans une population à faible prévalence des mutants.