Associations of autozygosity with a broad range of human phenotypes.

Détails

Ressource 1Télécharger: 31673082_BIB_330E6BC9074E.pdf (5386.21 [Ko])
Etat: Public
Version: de l'auteur⸱e
Licence: CC BY 4.0
ID Serval
serval:BIB_330E6BC9074E
Type
Article: article d'un périodique ou d'un magazine.
Collection
Publications
Institution
Titre
Associations of autozygosity with a broad range of human phenotypes.
Périodique
Nature communications
Auteur⸱e⸱s
Clark D.W., Okada Y., Moore KHS, Mason D., Pirastu N., Gandin I., Mattsson H., Barnes CLK, Lin K., Zhao J.H., Deelen P., Rohde R., Schurmann C., Guo X., Giulianini F., Zhang W., Medina-Gomez C., Karlsson R., Bao Y., Bartz T.M., Baumbach C., Biino G., Bixley M.J., Brumat M., Chai J.F., Corre T., Cousminer D.L., Dekker A.M., Eccles D.A., van Eijk K.R., Fuchsberger C., Gao H., Germain M., Gordon S.D., de Haan H.G., Harris S.E., Hofer E., Huerta-Chagoya A., Igartua C., Jansen I.E., Jia Y., Kacprowski T., Karlsson T., Kleber M.E., Li S.A., Li-Gao R., Mahajan A., Matsuda K., Meidtner K., Meng W., Montasser M.E., van der Most P.J., Munz M., Nutile T., Palviainen T., Prasad G., Prasad R.B., Priyanka TDS, Rizzi F., Salvi E., Sapkota B.R., Shriner D., Skotte L., Smart M.C., Smith A.V., van der Spek A., Spracklen C.N., Strawbridge R.J., Tajuddin S.M., Trompet S., Turman C., Verweij N., Viberti C., Wang L., Warren H.R., Wootton R.E., Yanek L.R., Yao J., Yousri N.A., Zhao W., Adeyemo A.A., Afaq S., Aguilar-Salinas C.A., Akiyama M., Albert M.L., Allison M.A., Alver M., Aung T., Azizi F., Bentley A.R., Boeing H., Boerwinkle E., Borja J.B., de Borst G.J., Bottinger E.P., Broer L., Campbell H., Chanock S., Chee M.L., Chen G., Chen Y.I., Chen Z., Chiu Y.F., Cocca M., Collins F.S., Concas M.P., Corley J., Cugliari G., van Dam R.M., Damulina A., Daneshpour M.S., Day F.R., Delgado G.E., Dhana K., Doney ASF, Dörr M., Doumatey A.P., Dzimiri N., Ebenesersdóttir S.S., Elliott J., Elliott P., Ewert R., Felix J.F., Fischer K., Freedman B.I., Girotto G., Goel A., Gögele M., Goodarzi M.O., Graff M., Granot-Hershkovitz E., Grodstein F., Guarrera S., Gudbjartsson D.F., Guity K., Gunnarsson B., Guo Y., Hagenaars S.P., Haiman C.A., Halevy A., Harris T.B., Hedayati M., van Heel D.A., Hirata M., Höfer I., Hsiung C.A., Huang J., Hung Y.J., Ikram M.A., Jagadeesan A., Jousilahti P., Kamatani Y., Kanai M., Kerrison N.D., Kessler T., Khaw K.T., Khor C.C., de Kleijn DPV, Koh W.P., Kolcic I., Kraft P., Krämer B.K., Kutalik Z., Kuusisto J., Langenberg C., Launer L.J., Lawlor D.A., Lee I.T., Lee W.J., Lerch M.M., Li L., Liu J., Loh M., London S.J., Loomis S., Lu Y., Luan J., Mägi R., Manichaikul A.W., Manunta P., Másson G., Matoba N., Mei X.W., Meisinger C., Meitinger T., Mezzavilla M., Milani L., Millwood I.Y., Momozawa Y., Moore A., Morange P.E., Moreno-Macías H., Mori T.A., Morrison A.C., Muka T., Murakami Y., Murray A.D., de Mutsert R., Mychaleckyj J.C., Nalls M.A., Nauck M., Neville M.J., Nolte I.M., Ong K.K., Orozco L., Padmanabhan S., Pálsson G., Pankow J.S., Pattaro C., Pattie A., Polasek O., Poulter N., Pramstaller P.P., Quintana-Murci L., Räikkönen K., Ralhan S., Rao D.C., van Rheenen W., Rich S.S., Ridker P.M., Rietveld C.A., Robino A., van Rooij FJA, Ruggiero D., Saba Y., Sabanayagam C., Sabater-Lleal M., Sala C.F., Salomaa V., Sandow K., Schmidt H., Scott L.J., Scott W.R., Sedaghati-Khayat B., Sennblad B., van Setten J., Sever P.J., Sheu W.H., Shi Y., Shrestha S., Shukla S.R., Sigurdsson J.K., Sikka T.T., Singh J.R., Smith B.H., Stančáková A., Stanton A., Starr J.M., Stefansdottir L., Straker L., Sulem P., Sveinbjornsson G., Swertz M.A., Taylor A.M., Taylor K.D., Terzikhan N., Tham Y.C., Thorleifsson G., Thorsteinsdottir U., Tillander A., Tracy R.P., Tusié-Luna T., Tzoulaki I., Vaccargiu S., Vangipurapu J., Veldink J.H., Vitart V., Völker U., Vuoksimaa E., Wakil S.M., Waldenberger M., Wander G.S., Wang Y.X., Wareham N.J., Wild S., Yajnik C.S., Yuan J.M., Zeng L., Zhang L., Zhou J., Amin N., Asselbergs F.W., Bakker SJL, Becker D.M., Lehne B., Bennett D.A., van den Berg L.H., Berndt S.I., Bharadwaj D., Bielak L.F., Bochud M., Boehnke M., Bouchard C., Bradfield J.P., Brody J.A., Campbell A., Carmi S., Caulfield M.J., Cesarini D., Chambers J.C., Chandak G.R., Cheng C.Y., Ciullo M., Cornelis M., Cusi D., Smith G.D., Deary I.J., Dorajoo R., van Duijn C.M., Ellinghaus D., Erdmann J., Eriksson J.G., Evangelou E., Evans M.K., Faul J.D., Feenstra B., Feitosa M., Foisy S., Franke A., Friedlander Y., Gasparini P., Gieger C., Gonzalez C., Goyette P., Grant SFA, Griffiths L.R., Groop L., Gudnason V., Gyllensten U., Hakonarson H., Hamsten A., van der Harst P., Heng C.K., Hicks A.A., Hochner H., Huikuri H., Hunt S.C., Jaddoe VWV, De Jager P.L., Johannesson M., Johansson Å., Jonas J.B., Jukema J.W., Junttila J., Kaprio J., Kardia SLR, Karpe F., Kumari M., Laakso M., van der Laan S.W., Lahti J., Laudes M., Lea R.A., Lieb W., Lumley T., Martin N.G., März W., Matullo G., McCarthy M.I., Medland S.E., Merriman T.R., Metspalu A., Meyer B.F., Mohlke K.L., Montgomery G.W., Mook-Kanamori D., Munroe P.B., North K.E., Nyholt D.R., O'connell J.R., Ober C., Oldehinkel A.J., Palmas W., Palmer C., Pasterkamp G.G., Patin E., Pennell C.E., Perusse L., Peyser P.A., Pirastu M., Polderman TJC, Porteous D.J., Posthuma D., Psaty B.M., Rioux J.D., Rivadeneira F., Rotimi C., Rotter J.I., Rudan I., Den Ruijter H.M., Sanghera D.K., Sattar N., Schmidt R., Schulze M.B., Schunkert H., Scott R.A., Shuldiner A.R., Sim X., Small N., Smith J.A., Sotoodehnia N., Tai E.S., Teumer A., Timpson N.J., Toniolo D., Tregouet D.A., Tuomi T., Vollenweider P., Wang C.A., Weir D.R., Whitfield J.B., Wijmenga C., Wong T.Y., Wright J., Yang J., Yu L., Zemel B.S., Zonderman A.B., Perola M., Magnusson PKE, Uitterlinden A.G., Kooner J.S., Chasman D.I., Loos RJF, Franceschini N., Franke L., Haley C.S., Hayward C., Walters R.G., Perry JRB, Esko T., Helgason A., Stefansson K., Joshi P.K., Kubo M., Wilson J.F.
ISSN
2041-1723 (Electronic)
ISSN-L
2041-1723
Statut éditorial
Publié
Date de publication
31/10/2019
Peer-reviewed
Oui
Volume
10
Numéro
1
Pages
4957
Langue
anglais
Notes
Publication types: Journal Article
Publication Status: epublish
Résumé
In many species, the offspring of related parents suffer reduced reproductive success, a phenomenon known as inbreeding depression. In humans, the importance of this effect has remained unclear, partly because reproduction between close relatives is both rare and frequently associated with confounding social factors. Here, using genomic inbreeding coefficients (F <sub>ROH</sub> ) for >1.4 million individuals, we show that F <sub>ROH</sub> is significantly associated (p < 0.0005) with apparently deleterious changes in 32 out of 100 traits analysed. These changes are associated with runs of homozygosity (ROH), but not with common variant homozygosity, suggesting that genetic variants associated with inbreeding depression are predominantly rare. The effect on fertility is striking: F <sub>ROH</sub> equivalent to the offspring of first cousins is associated with a 55% decrease [95% CI 44-66%] in the odds of having children. Finally, the effects of F <sub>ROH</sub> are confirmed within full-sibling pairs, where the variation in F <sub>ROH</sub> is independent of all environmental confounding.
Pubmed
Web of science
Open Access
Oui
Création de la notice
05/11/2019 11:13
Dernière modification de la notice
30/04/2021 6:09
Données d'usage