Associations of autozygosity with a broad range of human phenotypes.

Details

Serval ID
serval:BIB_330E6BC9074E
Type
Article: article from journal or magazin.
Collection
Publications
Institution
Title
Associations of autozygosity with a broad range of human phenotypes.
Journal
Nature communications
Author(s)
Clark D.W., Okada Y., Moore KHS, Mason D., Pirastu N., Gandin I., Mattsson H., Barnes CLK, Lin K., Zhao J.H., Deelen P., Rohde R., Schurmann C., Guo X., Giulianini F., Zhang W., Medina-Gomez C., Karlsson R., Bao Y., Bartz T.M., Baumbach C., Biino G., Bixley M.J., Brumat M., Chai J.F., Corre T., Cousminer D.L., Dekker A.M., Eccles D.A., van Eijk K.R., Fuchsberger C., Gao H., Germain M., Gordon S.D., de Haan H.G., Harris S.E., Hofer E., Huerta-Chagoya A., Igartua C., Jansen I.E., Jia Y., Kacprowski T., Karlsson T., Kleber M.E., Li S.A., Li-Gao R., Mahajan A., Matsuda K., Meidtner K., Meng W., Montasser M.E., van der Most P.J., Munz M., Nutile T., Palviainen T., Prasad G., Prasad R.B., Priyanka TDS, Rizzi F., Salvi E., Sapkota B.R., Shriner D., Skotte L., Smart M.C., Smith A.V., van der Spek A., Spracklen C.N., Strawbridge R.J., Tajuddin S.M., Trompet S., Turman C., Verweij N., Viberti C., Wang L., Warren H.R., Wootton R.E., Yanek L.R., Yao J., Yousri N.A., Zhao W., Adeyemo A.A., Afaq S., Aguilar-Salinas C.A., Akiyama M., Albert M.L., Allison M.A., Alver M., Aung T., Azizi F., Bentley A.R., Boeing H., Boerwinkle E., Borja J.B., de Borst G.J., Bottinger E.P., Broer L., Campbell H., Chanock S., Chee M.L., Chen G., Chen Y.I., Chen Z., Chiu Y.F., Cocca M., Collins F.S., Concas M.P., Corley J., Cugliari G., van Dam R.M., Damulina A., Daneshpour M.S., Day F.R., Delgado G.E., Dhana K., Doney ASF, Dörr M., Doumatey A.P., Dzimiri N., Ebenesersdóttir S.S., Elliott J., Elliott P., Ewert R., Felix J.F., Fischer K., Freedman B.I., Girotto G., Goel A., Gögele M., Goodarzi M.O., Graff M., Granot-Hershkovitz E., Grodstein F., Guarrera S., Gudbjartsson D.F., Guity K., Gunnarsson B., Guo Y., Hagenaars S.P., Haiman C.A., Halevy A., Harris T.B., Hedayati M., van Heel D.A., Hirata M., Höfer I., Hsiung C.A., Huang J., Hung Y.J., Ikram M.A., Jagadeesan A., Jousilahti P., Kamatani Y., Kanai M., Kerrison N.D., Kessler T., Khaw K.T., Khor C.C., de Kleijn DPV, Koh W.P., Kolcic I., Kraft P., Krämer B.K., Kutalik Z., Kuusisto J., Langenberg C., Launer L.J., Lawlor D.A., Lee I.T., Lee W.J., Lerch M.M., Li L., Liu J., Loh M., London S.J., Loomis S., Lu Y., Luan J., Mägi R., Manichaikul A.W., Manunta P., Másson G., Matoba N., Mei X.W., Meisinger C., Meitinger T., Mezzavilla M., Milani L., Millwood I.Y., Momozawa Y., Moore A., Morange P.E., Moreno-Macías H., Mori T.A., Morrison A.C., Muka T., Murakami Y., Murray A.D., de Mutsert R., Mychaleckyj J.C., Nalls M.A., Nauck M., Neville M.J., Nolte I.M., Ong K.K., Orozco L., Padmanabhan S., Pálsson G., Pankow J.S., Pattaro C., Pattie A., Polasek O., Poulter N., Pramstaller P.P., Quintana-Murci L., Räikkönen K., Ralhan S., Rao D.C., van Rheenen W., Rich S.S., Ridker P.M., Rietveld C.A., Robino A., van Rooij FJA, Ruggiero D., Saba Y., Sabanayagam C., Sabater-Lleal M., Sala C.F., Salomaa V., Sandow K., Schmidt H., Scott L.J., Scott W.R., Sedaghati-Khayat B., Sennblad B., van Setten J., Sever P.J., Sheu W.H., Shi Y., Shrestha S., Shukla S.R., Sigurdsson J.K., Sikka T.T., Singh J.R., Smith B.H., Stančáková A., Stanton A., Starr J.M., Stefansdottir L., Straker L., Sulem P., Sveinbjornsson G., Swertz M.A., Taylor A.M., Taylor K.D., Terzikhan N., Tham Y.C., Thorleifsson G., Thorsteinsdottir U., Tillander A., Tracy R.P., Tusié-Luna T., Tzoulaki I., Vaccargiu S., Vangipurapu J., Veldink J.H., Vitart V., Völker U., Vuoksimaa E., Wakil S.M., Waldenberger M., Wander G.S., Wang Y.X., Wareham N.J., Wild S., Yajnik C.S., Yuan J.M., Zeng L., Zhang L., Zhou J., Amin N., Asselbergs F.W., Bakker SJL, Becker D.M., Lehne B., Bennett D.A., van den Berg L.H., Berndt S.I., Bharadwaj D., Bielak L.F., Bochud M., Boehnke M., Bouchard C., Bradfield J.P., Brody J.A., Campbell A., Carmi S., Caulfield M.J., Cesarini D., Chambers J.C., Chandak G.R., Cheng C.Y., Ciullo M., Cornelis M., Cusi D., Smith G.D., Deary I.J., Dorajoo R., van Duijn C.M., Ellinghaus D., Erdmann J., Eriksson J.G., Evangelou E., Evans M.K., Faul J.D., Feenstra B., Feitosa M., Foisy S., Franke A., Friedlander Y., Gasparini P., Gieger C., Gonzalez C., Goyette P., Grant SFA, Griffiths L.R., Groop L., Gudnason V., Gyllensten U., Hakonarson H., Hamsten A., van der Harst P., Heng C.K., Hicks A.A., Hochner H., Huikuri H., Hunt S.C., Jaddoe VWV, De Jager P.L., Johannesson M., Johansson Å., Jonas J.B., Jukema J.W., Junttila J., Kaprio J., Kardia SLR, Karpe F., Kumari M., Laakso M., van der Laan S.W., Lahti J., Laudes M., Lea R.A., Lieb W., Lumley T., Martin N.G., März W., Matullo G., McCarthy M.I., Medland S.E., Merriman T.R., Metspalu A., Meyer B.F., Mohlke K.L., Montgomery G.W., Mook-Kanamori D., Munroe P.B., North K.E., Nyholt D.R., O'connell J.R., Ober C., Oldehinkel A.J., Palmas W., Palmer C., Pasterkamp G.G., Patin E., Pennell C.E., Perusse L., Peyser P.A., Pirastu M., Polderman TJC, Porteous D.J., Posthuma D., Psaty B.M., Rioux J.D., Rivadeneira F., Rotimi C., Rotter J.I., Rudan I., Den Ruijter H.M., Sanghera D.K., Sattar N., Schmidt R., Schulze M.B., Schunkert H., Scott R.A., Shuldiner A.R., Sim X., Small N., Smith J.A., Sotoodehnia N., Tai E.S., Teumer A., Timpson N.J., Toniolo D., Tregouet D.A., Tuomi T., Vollenweider P., Wang C.A., Weir D.R., Whitfield J.B., Wijmenga C., Wong T.Y., Wright J., Yang J., Yu L., Zemel B.S., Zonderman A.B., Perola M., Magnusson PKE, Uitterlinden A.G., Kooner J.S., Chasman D.I., Loos RJF, Franceschini N., Franke L., Haley C.S., Hayward C., Walters R.G., Perry JRB, Esko T., Helgason A., Stefansson K., Joshi P.K., Kubo M., Wilson J.F.
ISSN
2041-1723 (Electronic)
ISSN-L
2041-1723
Publication state
Published
Issued date
31/10/2019
Peer-reviewed
Oui
Volume
10
Number
1
Pages
4957
Language
english
Notes
Publication types: Journal Article
Publication Status: epublish
Abstract
In many species, the offspring of related parents suffer reduced reproductive success, a phenomenon known as inbreeding depression. In humans, the importance of this effect has remained unclear, partly because reproduction between close relatives is both rare and frequently associated with confounding social factors. Here, using genomic inbreeding coefficients (F <sub>ROH</sub> ) for >1.4 million individuals, we show that F <sub>ROH</sub> is significantly associated (p < 0.0005) with apparently deleterious changes in 32 out of 100 traits analysed. These changes are associated with runs of homozygosity (ROH), but not with common variant homozygosity, suggesting that genetic variants associated with inbreeding depression are predominantly rare. The effect on fertility is striking: F <sub>ROH</sub> equivalent to the offspring of first cousins is associated with a 55% decrease [95% CI 44-66%] in the odds of having children. Finally, the effects of F <sub>ROH</sub> are confirmed within full-sibling pairs, where the variation in F <sub>ROH</sub> is independent of all environmental confounding.
Pubmed
Web of science
Open Access
Yes
Create date
05/11/2019 11:13
Last modification date
18/01/2020 6:26
Usage data