Actuellement cinq espèces du parasite intracellulaire Plasmodium sont identifiées comme pathogènes pour l'homme. Dans nos régions tempérées, nous sommes à présent confrontés essentiellement aux cas importés. A noter que le travail de cette thèse porte sur le diagnostic de quatre espèces de Plasmodium, soit P. falciparum, P. ovale, P. vivax et P. malariae. La dernière espèce, P. knowlesi, n'a été que récemment identifiée comme pathogène et n'a de ce fait pas été incluse dans nos études. A noter qu'elle n'a, selon l'Office Fédérale de la Santé Publique, encore jamais été observée en Suisse.
Cette thèse évalue le rôle de l'une des techniques moléculaires, la Polymerase Chain Reaction quantitative ou qPCR, dans le diagnostic de la malaria, en la comparant avec la technique considérée encore actuellement comme gold standard, la microscopie optique et en la comparant également à la sévérité de la maladie.
Le premier article, Multiplex real-time PCR for the diagnosis of malaria : corrélation with microscopy, publié en 2010 dans le Clinical Microbiology and Infection, traite de la comparaison entre deux techniques diagnostiques (PCR et microscopie) pour l'identification des espèces de Plasmodium, ainsi que pour la quantification de la charge parasitaire.
Nous démontrons ainsi qu'elle joue un rôle important dans les cas de diagnostic difficile, ce qui est le cas pour les parasitémies faibles ou en cas de coinfections avec deux, voire trois espèces de Plasmodium. Nous démontrons également que la quantification par PCR est corrélée à la quantification par microscopie optique et pourrait être ainsi utile dans la recherche de nouveaux traitements, par exemple par un monitoring plus précis de leur efficacité.
Le deuxième article, Multiplex real-time PCR for the diagnosis of malaria : corrélation with microscopy and clinical présentation, publié en février 2015, est une étude qui résulte des données cliniques récoltées lors du premier travail et qui compare les parasitémies estimées par microscopie et PCR avec la clinique. La quantification par PCR permet de démontrer une corrélation significative entre le degré de sévérité de la clinique et la charge parasitaire. La PCR pourrait ainsi jouer un rôle pour aider à prédire l'outcome et diriger les traitements administrés.
Les deux articles sont présentés ensemble car ils sont tirés du même travail de recherche initial et bien que publiés à plusieurs années d'intervalle, restent intéressants également dans leur complémentarité.