Même si elles sont en diminution dans notre pays, les infections sexuellement transmissibles - en particulier celles dues à Chlamydia trachomatis et Neisseria gonorrhoeae - peuvent poser des problèmes de diagnostic en raison de la pauvreté des signes cliniques spécifiques, de l'existence de nombreux cas asymptomatiques et de la grande variabilité en termes de sensibilité des méthodes de diagnostic de laboratoire. Si pour N. gonorrhoeae, la culture sur milieux sélectifs reste la méthode de choix, pour C. trachomatis, l'amplification génique (PCR, LCR) a supplanté la culture cellulaire, notamment en raison d'une sensibilité nettement supérieure. De plus, avec ces méthodes moléculaires, pour C. trachomatis en particulier, un prélèvement d'urines donne des résultats au moins équivalents à ceux obtenus avec un prélèvement au niveau du col ou de l'urètre, rendant ainsi le screening des populations à risque beaucoup plus aisé.