A Gene Ontology Tutorial in Python.

Détails

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Accès restreint UNIL
Etat: Public
Version: Final published version
Licence: Non spécifiée
ID Serval
serval:BIB_6D82D9E2A2D4
Type
Partie de livre
Sous-type
Chapitre: chapitre ou section
Collection
Publications
Institution
Titre
A Gene Ontology Tutorial in Python.
Titre du livre
Methods in molecular biology
Auteur⸱e⸱s
Vesztrocy A.W., Dessimoz C.
Editeur
Springer
ISSN
1940-6029 (Electronic)
ISSN-L
1064-3745
Statut éditorial
Publié
Date de publication
2017
Peer-reviewed
Oui
Volume
1446
Numéro de chapitre
16
Pages
221-229
Langue
anglais
Résumé
This chapter is a tutorial on using Gene Ontology resources in the Python programming language. This entails querying the Gene Ontology graph, retrieving Gene Ontology annotations, performing gene enrichment analyses, and computing basic semantic similarity between GO terms. An interactive version of the tutorial, including solutions, is available at http://gohandbook.org .
Mots-clé
Animals, Gene Ontology, Humans, Internet, Molecular Sequence Annotation/methods, Semantics, Software, Python, Tutorial
Pubmed
Open Access
Oui
Création de la notice
30/11/2016 21:38
Dernière modification de la notice
30/07/2024 6:02
Données d'usage