Les tests de dépistage des anti-VIH-1 VIH-2 de 3 génération ont permis de raccourcir la fenêtre séronégative de cinq jours en moyenne en cas de séroconversion. De nouveaux tests, dits de 4 génération, permettent de raccourcir cette fenêtre de cinq jours supplémentaires environ, grâce à la détection simultanée des anti-VIH-1 VIH-2 et de l'antigène p24 du VIH-1. On connaît de mieux en mieux les sous-types non-B du VIH-1, qui prédominent en Afrique et en Asie; ces sous-types peuvent poser des problèmes pour le sérodiagnostic et pour la quantification de la charge virale. La PCR et d'autres méthodes de biologie moléculaire pour la quantification de la charge virale ont révolutionné le suivi des patients infectés. Des méthodes de PCR «super-sensibles» permettent dès à présent de mieux contrôler l'efficacité des antirétroviraux.