The Cancer Genome Atlas Pan-Cancer analysis project.

Details

Serval ID
serval:BIB_C57BBA47F548
Type
Article: article from journal or magazin.
Collection
Publications
Title
The Cancer Genome Atlas Pan-Cancer analysis project.
Journal
Nature genetics
Author(s)
Weinstein J.N., Collisson E.A., Mills G.B., Shaw K.R., Ozenberger B.A., Ellrott K., Shmulevich I., Sander C., Stuart J.M.
Working group(s)
Cancer Genome Atlas Research Network
Contributor(s)
Chang K., Creighton C.J., Davis C., Donehower L., Drummond J., Wheeler D., Ally A., Balasundaram M., Birol I., Butterfield S.N., Chu A., Chuah E., Chun H.J., Dhalla N., Guin R., Hirst M., Hirst C., Holt R.A., Jones S.J., Lee D., Li H.I., Marra M.A., Mayo M., Moore R.A., Mungall A.J., Robertson A.G., Schein J.E., Sipahimalani P., Tam A., Thiessen N., Varhol R.J., Beroukhim R., Bhatt A.S., Brooks A.N., Cherniack A.D., Freeman S.S., Gabriel S.B., Helman E., Jung J., Meyerson M., Ojesina A.I., Pedamallu C.S., Saksena G., Schumacher S.E., Tabak B., Zack T., Lander E.S., Bristow C.A., Hadjipanayis A., Haseley P., Kucherlapati R., Lee S., Lee E., Luquette L.J., Mahadeshwar H.S., Pantazi A., Parfenov M., Park P.J., Protopopov A., Ren X., Santoso N., Seidman J., Seth S., Song X., Tang J., Xi R., Xu A.W., Yang L., Zeng D., Auman J.T., Balu S., Buda E., Fan C., Hoadley K.A., Jones C.D., Meng S., Mieczkowski P.A., Parker J.S., Perou C.M., Roach J., Shi Y., Silva G.O., Tan D., Veluvolu U., Waring S., Wilkerson M.D., Wu J., Zhao W., Bodenheimer T., Hayes D.N., Hoyle A.P., Jeffreys S.R., Mose L.E., Simons J.V., Soloway M.G., Baylin S.B., Berman B.P., Bootwalla M.S., Danilova L., Herman J.G., Hinoue T., Laird P.W., Rhie S.K., Shen H., Triche T., Weisenberger D.J., Carter S.L., Cibulskis K., Chin L., Zhang J., Getz G., Sougnez C., Wang M., Saksena G., Carter S.L., Cibulskis K., Chin L., Zhang J., Getz G., Dinh H., Doddapaneni H.V., Gibbs R., Gunaratne P., Han Y., Kalra D., Kovar C., Lewis L., Morgan M., Morton D., Muzny D., Reid J., Xi L., Cho J., DiCara D., Frazer S., Gehlenborg N., Heiman D.I., Kim J., Lawrence M.S., Lin P., Liu Y., Noble M.S., Stojanov P., Voet D., Zhang H., Zou L., Stewart C., Bernard B., Bressler R., Eakin A., Iype L., Knijnenburg T., Kramer R., Kreisberg R., Leinonen K., Lin J., Liu Y., Miller M., Reynolds S.M., Rovira H., Shmulevich I., Thorsson V., Yang D., Zhang W., Amin S., Wu C.J., Wu C.C., Akbani R., Aldape K., Baggerly K.A., Broom B., Casasent T.D., Cleland J., Creighton C., Dodda D., Edgerton M., Han L., Herbrich S.M., Ju Z., Kim H., Lerner S., Li J., Liang H., Liu W., Lorenzi P.L., Lu Y., Melott J., Mills G.B., Nguyen L., Su X., Verhaak R., Wang W., Weinstein J.N., Wong A., Yang Y., Yao J., Yao R., Yoshihara K., Yuan Y., Yung A.K., Zhang N., Zheng S., Ryan M., Kane D.W., Aksoy B.A., Ciriello G., Dresdner G., Gao J., Gross B., Jacobsen A., Kahles A., Ladanyi M., Lee W., Lehmann K.V., Miller M.L., Ramirez R., Rätsch G., Reva B., Sander C., Schultz N., Senbabaoglu Y., Shen R., Sinha R., Sumer S.O., Sun Y., Taylor B.S., Weinhold N., Fei S., Spellman P., Benz C., Carlin D., Cline M., Craft B., Ellrott K., Goldman M., Haussler D., Ma S., Ng S., Paull E., Radenbaugh A., Salama S., Sokolov A., Stuart J.M., Swatloski T., Uzunangelov V., Waltman P., Yau C., Zhu J., Hamilton S.R., Getz G., Sougnez C., Abbott S., Abbott R., Dees N.D., Delehaunty K., Ding L., Dooling D.J., Eldred J.M., Fronick C.C., Fulton R., Fulton L.L., Kalicki-Veizer J., Kanchi K.L., Kandoth C., Koboldt D.C., Larson D.E., Ley T.J., Lin L., Lu C., Magrini V.J., Mardis E.R., McLellan M.D., McMichael J.F., Miller C.A., O'Laughlin M., Pohl C., Schmidt H., Smith S.M., Walker J., Wallis J.W., Wendl M.C., Wilson R.K., Wylie T., Zhang Q., Burton R., Jensen M.A., Kahn A., Pihl T., Pot D., Wan Y., Levine D.A., Black A.D., Bowen J., Frick J., Gastier-Foster J.M., Harper H.A., Helsel C., Leraas K.M., Lichtenberg T.M., McAllister C., Ramirez N.C., Sharpe S., Wise L., Zmuda E., Chanock S.J., Davidsen T., Demchok J.A., Eley G., Felau I., Ozenberger B.A., Sheth M., Sofia H., Staudt L., Tarnuzzer R., Wang Z., Yang L., Zhang J., Omberg L., Margolin A., Raphael B.J., Vandin F., Wu H.T., Leiserson M.D., Benz S.C., Vaske C.J., Noushmehr H., Knijnenburg T., Wolf D., Van 't Veer L., Collisson E.A., Anastassiou D., Ou Yang T.H., Lopez-Bigas N., Gonzalez-Perez A., Tamborero D., Xia Z., Li W., Cho D.Y., Przytycka T., Hamilton M., McGuire S., Nelander S., Johansson P., Jörnsten R., Kling T., Sanchez J.
ISSN
1546-1718 (Electronic)
ISSN-L
1061-4036
Publication state
Published
Issued date
10/2013
Peer-reviewed
Oui
Volume
45
Number
10
Pages
1113-1120
Language
english
Notes
Publication types: Journal Article ; Research Support, N.I.H., Extramural
Publication Status: ppublish
Abstract
The Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network has profiled and analyzed large numbers of human tumors to discover molecular aberrations at the DNA, RNA, protein and epigenetic levels. The resulting rich data provide a major opportunity to develop an integrated picture of commonalities, differences and emergent themes across tumor lineages. The Pan-Cancer initiative compares the first 12 tumor types profiled by TCGA. Analysis of the molecular aberrations and their functional roles across tumor types will teach us how to extend therapies effective in one cancer type to others with a similar genomic profile.
Keywords
Gene Expression Profiling, Genome, Humans, Neoplasms/genetics, Neoplasms/pathology
Pubmed
Web of science
Open Access
Yes
Create date
06/07/2018 12:02
Last modification date
20/08/2019 16:41
Usage data