A catalog of genetic loci associated with kidney function from analyses of a million individuals.

Details

Request a copyRequest a copy
Serval ID
serval:BIB_9B3824B99372
Type
Article: article from journal or magazin.
Collection
Publications
Institution
UNIL/CHUV
Title
A catalog of genetic loci associated with kidney function from analyses of a million individuals.
Journal
Nature genetics
Author(s)
Wuttke M., Li Y., Li M., Sieber K.B., Feitosa M.F., Gorski M., Tin A., Wang L., Chu A.Y., Hoppmann A., Kirsten H., Giri A., Chai J.F., Sveinbjornsson G., Tayo B.O., Nutile T., Fuchsberger C., Marten J., Cocca M., Ghasemi S., Xu Y., Horn K., Noce D., van der Most P.J., Sedaghat S., Yu Z., Akiyama M., Afaq S., Ahluwalia T.S., Almgren P., Amin N., Ärnlöv J., Bakker SJL, Bansal N., Baptista D., Bergmann S., Biggs M.L., Biino G., Boehnke M., Boerwinkle E., Boissel M., Bottinger E.P., Boutin T.S., Brenner H., Brumat M., Burkhardt R., Butterworth A.S., Campana E., Campbell A., Campbell H., Canouil M., Carroll R.J., Catamo E., Chambers J.C., Chee M.L., Chee M.L., Chen X., Cheng C.Y., Cheng Y., Christensen K., Cifkova R., Ciullo M., Concas M.P., Cook J.P., Coresh J., Corre T., Sala C.F., Cusi D., Danesh J., Daw E.W., de Borst M.H., De Grandi A., de Mutsert R., de Vries APJ, Degenhardt F., Delgado G., Demirkan A., Di Angelantonio E., Dittrich K., Divers J., Dorajoo R., Eckardt K.U., Ehret G., Elliott P., Endlich K., Evans M.K., Felix J.F., Foo VHX, Franco O.H., Franke A., Freedman B.I., Freitag-Wolf S., Friedlander Y., Froguel P., Gansevoort R.T., Gao H., Gasparini P., Gaziano J.M., Giedraitis V., Gieger C., Girotto G., Giulianini F., Gögele M., Gordon S.D., Gudbjartsson D.F., Gudnason V., Haller T., Hamet P., Harris T.B., Hartman C.A., Hayward C., Hellwege J.N., Heng C.K., Hicks A.A., Hofer E., Huang W., Hutri-Kähönen N., Hwang S.J., Ikram M.A., Indridason O.S., Ingelsson E., Ising M., Jaddoe VWV, Jakobsdottir J., Jonas J.B., Joshi P.K., Josyula N.S., Jung B., Kähönen M., Kamatani Y., Kammerer C.M., Kanai M., Kastarinen M., Kerr S.M., Khor C.C., Kiess W., Kleber M.E., Koenig W., Kooner J.S., Körner A., Kovacs P., Kraja A.T., Krajcoviechova A., Kramer H., Krämer B.K., Kronenberg F., Kubo M., Kühnel B., Kuokkanen M., Kuusisto J., La Bianca M., Laakso M., Lange L.A., Langefeld C.D., Lee J.J., Lehne B., Lehtimäki T., Lieb W., Lim S.C., Lind L., Lindgren C.M., Liu J., Liu J., Loeffler M., Loos RJF, Lucae S., Lukas M.A., Lyytikäinen L.P., Mägi R., Magnusson PKE, Mahajan A., Martin N.G., Martins J., März W., Mascalzoni D., Matsuda K., Meisinger C., Meitinger T., Melander O., Metspalu A., Mikaelsdottir E.K., Milaneschi Y., Miliku K., Mishra P.P., Mohlke K.L., Mononen N., Montgomery G.W., Mook-Kanamori D.O., Mychaleckyj J.C., Nadkarni G.N., Nalls M.A., Nauck M., Nikus K., Ning B., Nolte I.M., Noordam R., O'Connell J., O'Donoghue M.L., Olafsson I., Oldehinkel A.J., Orho-Melander M., Ouwehand W.H., Padmanabhan S., Palmer N.D., Palsson R., Penninx BWJH, Perls T., Perola M., Pirastu M., Pirastu N., Pistis G., Podgornaia A.I., Polasek O., Ponte B., Porteous D.J., Poulain T., Pramstaller P.P., Preuss M.H., Prins B.P., Province M.A., Rabelink T.J., Raffield L.M., Raitakari O.T., Reilly D.F., Rettig R., Rheinberger M., Rice K.M., Ridker P.M., Rivadeneira F., Rizzi F., Roberts D.J., Robino A., Rossing P., Rudan I., Rueedi R., Ruggiero D., Ryan K.A., Saba Y., Sabanayagam C., Salomaa V., Salvi E., Saum K.U., Schmidt H., Schmidt R., Schöttker B., Schulz C.A., Schupf N., Shaffer C.M., Shi Y., Smith A.V., Smith B.H., Soranzo N., Spracklen C.N., Strauch K., Stringham H.M., Stumvoll M., Svensson P.O., Szymczak S., Tai E.S., Tajuddin S.M., Tan NYQ, Taylor K.D., Teren A., Tham Y.C., Thiery J., Thio CHL, Thomsen H., Thorleifsson G., Toniolo D., Tönjes A., Tremblay J., Tzoulaki I., Uitterlinden A.G., Vaccargiu S., van Dam R.M., van der Harst P., van Duijn C.M., Velez Edward D.R., Verweij N., Vogelezang S., Völker U., Vollenweider P., Waeber G., Waldenberger M., Wallentin L., Wang Y.X., Wang C., Waterworth D.M., Bin Wei W., White H., Whitfield J.B., Wild S.H., Wilson J.F., Wojczynski M.K., Wong C., Wong T.Y., Xu L., Yang Q., Yasuda M., Yerges-Armstrong L.M., Zhang W., Zonderman A.B., Rotter J.I., Bochud M., Psaty B.M., Vitart V., Wilson J.G., Dehghan A., Parsa A., Chasman D.I., Ho K., Morris A.P., Devuyst O., Akilesh S., Pendergrass S.A., Sim X., Böger C.A., Okada Y., Edwards T.L., Snieder H., Stefansson K., Hung A.M., Heid I.M., Scholz M., Teumer A., Köttgen A., Pattaro C.
Working group(s)
Lifelines Cohort Study, V. A. Million Veteran Program
ISSN
1546-1718 (Electronic)
ISSN-L
1061-4036
Publication state
Published
Issued date
06/2019
Peer-reviewed
Oui
Volume
51
Number
6
Pages
957-972
Language
english
Notes
Publication types: Journal Article ; Meta-Analysis ; Research Support, Non-U.S. Gov't
Publication Status: ppublish
Abstract
Chronic kidney disease (CKD) is responsible for a public health burden with multi-systemic complications. Through trans-ancestry meta-analysis of genome-wide association studies of estimated glomerular filtration rate (eGFR) and independent replication (n = 1,046,070), we identified 264 associated loci (166 new). Of these, 147 were likely to be relevant for kidney function on the basis of associations with the alternative kidney function marker blood urea nitrogen (n = 416,178). Pathway and enrichment analyses, including mouse models with renal phenotypes, support the kidney as the main target organ. A genetic risk score for lower eGFR was associated with clinically diagnosed CKD in 452,264 independent individuals. Colocalization analyses of associations with eGFR among 783,978 European-ancestry individuals and gene expression across 46 human tissues, including tubulo-interstitial and glomerular kidney compartments, identified 17 genes differentially expressed in kidney. Fine-mapping highlighted missense driver variants in 11 genes and kidney-specific regulatory variants. These results provide a comprehensive priority list of molecular targets for translational research.
Keywords
Chromosome Mapping, European Continental Ancestry Group, Genetic Association Studies/methods, Genetic Predisposition to Disease, Genome-Wide Association Study, Glomerular Filtration Rate, Humans, Inheritance Patterns, Kidney Function Tests, Phenotype, Polymorphism, Single Nucleotide, Quantitative Trait Loci, Quantitative Trait, Heritable, Renal Insufficiency, Chronic/genetics, Renal Insufficiency, Chronic/physiopathology, Renal Insufficiency, Chronic/urine, Uromodulin/urine
OAI-PMH
oai:serval.unil.ch:BIB_9B3824B99372
DOI
10.1038/s41588-019-0407-x
Pubmed
31152163
Web of science
000469996900008
Create date
20/06/2019 7:59
Last modification date
20/08/2019 16:02
Usage data