The SIB Swiss Institute of Bioinformatics' resources: focus on curated databases.

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serval:BIB_71EF45D9A3D9
Type
Article: article from journal or magazin.
Publication sub-type
Review (review): journal as complete as possible of one specific subject, written based on exhaustive analyses from published work.
Collection
Publications
Institution
Title
The SIB Swiss Institute of Bioinformatics' resources: focus on curated databases.
Journal
Nucleic acids research
Author(s)
Bultet L.A.
Working group(s)
SIB Swiss Institute of Bioinformatics Members
Contributor(s)
Aguilar-Rodríguez J., Ahrens C.H., Ahrné E.L., Ai N., Aimo L., Akalin A., Aleksiev T., Alocci D., Altenhoff A., Alves I., Ambrosini G., Pedone P.A., Angelino P., Anisimova M., Appel R., Argoud-Puy G., Arnold K., Arpat B., Artimo P., Ascencao K., Auchincloss A., Axelsen K., Gerritsen V.B., Bairoch A., Bansal P., Baratin D., Barbato A., Barbié V., Barras D., Barreiro M., Barret S., Bastian F., Neto T.M., Baudis M., Beaudoing E., Beckmann J.S., Bekkar A.K., Cammoun L.B., Benmohammed S., Bernard M., Bertelli C., Bertoni M., Bienert S., Bignucolo O., Bilbao A., Bilican A., Blank D., Blatter M.C., Blum L., Bocquet J., Boeckmann B., Bolleman J.T., Bordoli L., Bosshard L., Bouchet G., Bougueleret L., Boutet E., Bovigny C., Bratulic S., Breuza L., Bridge A.J., Britan A., Brito F., Frazão J.B., Bruggmann R., Bucher P., Burdet F., Burger L., Cabello E.M., Gomez R.M., Calderon S., Cannarozzi G., Carl S., Casas C.C., Catherinet S., Périer R.C., Charpilloz C., Chaskar P.D., Chen W., Pepe A.C., Chopard B., Chu H.Y., Civic N., Claassen M., Clottu S., Colombo M., Cosandier I., Coudert E., Crespo I., Creus M., Cuche B., Cuendet M.A., Cusin I., Daga N., Daina A., Dauvillier J., David F., Davydov I., Manadelo Ferreira M.de S., de Beer T., de Castro E., de Santana C., Delafontaine J., Delorenzi M., Delucinge-Vivier C., Demirel Ö., Derham R., Dermitzakis E.M., Dib L., Diene S., Dilek N., Dilmi J., Domagalski M.J., Dorier J., Dornevil D., Dousse A., Dreos R., Duchen P., Roggli P.D., Duperret I.D., Durinx C., Duvaud S., Engler R., Erkek S., López P.E., Estreicher A., Excoffier L., Fabbretti R., Falcone J.L., Falquet L., Famiglietti M.L., Ferreira A.M., Feuermann M., Filliettaz M., Flegel V., Foucal A., Franceschini A., Fucile G., Gaidatzis D., Garcia V., Gasteiger E., Gateau A., Gatti L., Gaudet P., Gaudinat A., Gehant S., Gfeller D., Gharib W.H., Ghraichy M., Gidoin C., Gil M., Gleizes A., Gobeill J., Gonnet G., Gos A., Gotz L., Gouy A., Grbic D., Groux R., Gruaz-Gumowski N., Grun D., Gschwind A., Guex N., Gupta S., Gétaz M., Haake D., Haas J., Hatzimanikatis V., Heckel G., Gardiol D.F., Hinard V., Hinz U., Homicsko K., Horlacher O., Hosseini S.R., Hotz H.R., Hulo C., Hundsrucker C., Ibberson M., Ilmjärv S., Ioannidis V., Ioannidis P., Iseli C., Ivanek R., Iwaszkiewicz J., Jacquet P., Jacquot M., Jagannathan V., Jan M., Jensen J., Johansson M.U., Johner N., Jungo F., Junier T., Kahraman A., Katsantoni M., Keller G., Kerhornou A., Khalid F., Klingbiel D., Komljenovic A., Kriventseva E., Kryuchkova N., Kumar S., Kutalik Z., Kuznetsov D., Kuzyakiv R., Lane L., Lara V., Ledesma L., Leleu M., Lemercier P., Lew D., Lieberherr D., Liechti R., Lisacek F., Lischer H., Litsios G., Liu J., Lombardot T., Macé A., Maffioletti S., Mahi M.A., Maiolo M., Majjigapu S.R., Malmström L., Mangold V., Marek D., Mariethoz J., Marin R., Martin O., Martin X., Martín-Campos T., Mary C., Masclaux F., Masson P., Meier C., Messina A., Lenoir M.M., Meyer X., Michel P.A., Michielin O., Milanese A., Missiaglia E., Perez J.M., Caria V.M., Moret P., Moretti S., Morgat A., Mottaz A., Mottin L., Mouscaz Y., Mueller M., Murri R., Mylonas R., Neuenschwander S., Nikitin F., Niknejad A., Nouspikel N., Nso L.N., Okoniewski M., Omasits U., Paccaud B., Pachkov M., Paesano S.G., Pagni M., Palagi P.M., Pasche E., Payne J.L., Pedruzzi I., Peischl S., Peitsch M., Perlini S., Pilbout S., Podvinec M., Pohlmann R., Polizzi D., Potter D., Poux S., Pozzato M., Pradervand S., Praz V., Pruess M., Pujadas E., Racle J., Raschi M., Ratib O., Rausell A., de Laval V.R., Redaschi N., Rempfer C., Ren G., Vahdati R.A., Rib L., Grognuz O.R., Altimiras E.R., Rivoire C., Robin T., Robinson-Rechavi M., Rodrigues J., Roechert B., Roelli P., Romano V., Rossier G., Roth A., Rougemont J., Roux J., Royo H., Ruch P., Ruinelli M., Abdul Sater M.R., Röhrig U.F., Rüeger S., Salamin N., Sankar M., Sarkar N., Saxenhofer M., Schaeffer M., Schaerli Y., Schaper E., Schmid A., Schmid E., Schmid C., Schmid M., Schmidt S., Schmocker D., Schneider M., Schuepbach T., Schwede T., Schütz F., Sengstag T., Serrano M., Sethi A., Shahmirzadi O., Sigrist C., Silvestro D., Neto F.A., Simillion C., Simonovic M., Skunca N., Sluzek K., Soneson C., Sprouffske K., Stadler M., Staehli S., Stevenson B., Stockinger H., Straszewski J., Stricker T., Studer G., Stutz A., Suffiotti M., Sundaram S., Szklarczyk D., Szövenyi P., Tegenfeldt F., Teixeira D., Tellenbach S., Smith A.A., Tognolli M., Topolsky I., Van Du Tran T., Tsantoulis P., Tzika A.C., Agote A.U., van Nimwegen E., von Mering C., Varadarajan A., Veranneman M., Verbregue L., Veuthey A.L., Vishnyakova D., Vyas R., Wagner A., Walther D., Wan H.W., Wang M., Waterhouse R., Waterhouse A., Wicki A., Wigger L., Wirapati P., Witschi U., Wyder S., Wyler K., Wüthrich D., Xenarios I., Yamada K., Yan Z., Yasrebi H., Zahn M., Zangger N., Zdobnov E., Zerzion D., Zoete V., Zoller S., Abriata L., Aebischer T., Akhmedov M., Meireles Filho A.A., Andreozzi S., Appel N., Armand F., Arribas A., Asgari S., Ataman M., Audagnotto M., Aydin D., Bady P., Bank C., Barac D., Bargeton B., Barido-Sottani J., Barillari C., Bartha I., Bean A., Becker J., Beerenwinkel N., Bellement G., Benedetti F., Bergmann S., Berneche S., Bevers R., Biasse D., Bichsel M., Bieler J., Piccini A.P., Boareto do Amaral M., Bolliger C., Boskova V., Brown A., Bryois J., Buil A., Cannavo R., Cardner M., Carelli F.N., Carmona S., Cascione L., Chakrabarti A., Chaturvedi N., Choobdar S., Clivaz C., Constantinescu S., Corre T., Quezada D.C., Croce R., Cuendet A., Cui J., Dainese R., Peraro M.D., Dallavilla T., De Oliveira L., Delaleu N., Delaneau O., Deplancke B., Dharmarajan L., Diekmann M., Dimitrakopoulos C., Dimitriades-Schmutz B., Dimitrova Y.A., Dirmeier S., Dobay M.P., Dougoud M., Duc J., Dumont G., du Plessis L., Dörr D., Elfstroem K., Elmer F.J., Ewing G.B., Fanaswala I., Fellay J., Feller C., Fengos G., Ferrer A., Fiaux S., Field C., Finci I., Fofonjka A., Fonti G., Fried P., Frochaux M., Fuentes J., Galbusera L., Galimberti M., Garcia-Albornoz M., Garcia-Escudero R., Garieri M., Georgieva L., Ghiurcuta C.G., Ghosh S., Gnann A., Gnuegge R., Golumbeanu M., Gomez H., Goudet J., Gruber A.J., Gruhl F., Guethe S., Guillot E., Guimarães J., Gumienny R.W., Gunawan R., Gustafson K., Gypas F., Hadadi N., Hameri T., Hammer C., Heer F., Heller D.M., Hersch M., Hofmann A.L., Howald C., Hutter S., Iber D., Irwin K., Jahn K., Jedlinski D., Jethava V., Jorjani H., Julou T., Kaessmann H., Kalantzi A., Kanitz A., Kapopoulou A., Karamasioti E., Karimaddini Z., Keller I., Kiparissides A., Kohler M., Kousathanas A., Kuipers J., Kupczyk P., Kwee I., Kühnert D., Lakshmanan L.N., Lamparter D., Lang B., Laurent S., Laurent S., Leigh D., Lin Y., Lindsay H., Link V., Linnik J., Liphardt T., Liu Y., Loetscher A., Luomi A.O., Lykov K., Machlab D., Magnus C., Maillard-Wermelinger A., Malafeev A., Malaspinas A.S., Parera R.M., Manesso E., Manukyan L., Mapelli S.N., Marbach D., Lopez M.J., Wynn M.M., Martin G., Martins A.F., Matthes K., Mazza C., McDaid A., Mermet J., Michos O., Milinkovitch M.C., Misios A., Miskovic L., Mitov V., Mitra A., Mittal N., Montazeri H., Moret B., Naef F., Nair N., Nicolas D.L., Nicolet S., Noh H., Nowicka M., Oeyaas O., Omidi S., Ongen H., Ormond L., Ottoz D., Panousis N., Gao N.P., Modarres H.P., Pečerska J., Vieira J.P., Pivkin I., Planet E., Céspedes S.P., Pradhan R., Prados J., Racko D., Radigois M.F., Rasmussen D., Riba A., Rinn B., Rivoal M., Robinson M., Rossi S., Rudolf F., Rueedi R., Ruscheweyh H.J., Rybinski M., Rzepiela A.J., Sakoparnig T., San Román Rincón M.M., Savoglidis G., Scepanovic P., Schaad O., Schleiss R., Schmich F., Schmid E., Schmidt R., Schulthess S., Schwalie P.C., Seifert D., Seijo M., Shao M., Shim H., Singer J., Sobel J., Soh K.C., Flitman R.S., Soto S., Sousa V., Stadler T., Stasiak A., Stefani A., Steger Y., Stelling J., Stopka A., Stévant I., Sunnaker M., Syed A.P., Tamo G., Tanaka S., Theiler G., Thorball C.A., Thurnherr T., Ccenhua M.R., Tidin O., Tokic M., Riera M.T., Tomasini M., Tymoshenko S., Ud-Dean M., Urchueguia A., Quintero N.V., Vinckenbosch L., Viñuela A., Vollmer J., Voordijk S., Wang J., Wang Z., Warnefors M., Weber L.M., Wegmann D., Whitehead E., Wicky A., Widmer L., Ye M., Yerly F., Yeung J., Yordanov P., Zavolan M., Zehnder T., Zhang C., Zhou X., Zisaki A., Zoller B., Zollinger A.
ISSN
1362-4962 (Electronic)
ISSN-L
0305-1048
Publication state
Published
Issued date
04/01/2016
Peer-reviewed
Oui
Volume
44
Number
D1
Pages
D27-37
Language
english
Notes
Publication types: Journal Article ; Research Support, N.I.H., Extramural ; Research Support, Non-U.S. Gov't ; Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
Publication Status: ppublish
Abstract
The SIB Swiss Institute of Bioinformatics (www.isb-sib.ch) provides world-class bioinformatics databases, software tools, services and training to the international life science community in academia and industry. These solutions allow life scientists to turn the exponentially growing amount of data into knowledge. Here, we provide an overview of SIB's resources and competence areas, with a strong focus on curated databases and SIB's most popular and widely used resources. In particular, SIB's Bioinformatics resource portal ExPASy features over 150 resources, including UniProtKB/Swiss-Prot, ENZYME, PROSITE, neXtProt, STRING, UniCarbKB, SugarBindDB, SwissRegulon, EPD, arrayMap, Bgee, SWISS-MODEL Repository, OMA, OrthoDB and other databases, which are briefly described in this article.
Keywords
Computational Biology, Data Curation, Databases, Chemical, Databases, Genetic, Databases, Protein, Drug Design, Evolution, Molecular, Genomics, Humans, Phylogeny, Proteomics, Systems Biology
Pubmed
Web of science
Open Access
Yes
Create date
09/02/2016 10:27
Last modification date
10/02/2024 8:14
Usage data